Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUNX2Q13950 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNX2Q13950 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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