Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPSQ13938 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPSQ13938 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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