Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPTAN1Q13813 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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