Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
APOFQ13790 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
APOFQ13790 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOFQ13790 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOFQ13790 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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