Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALCAMQ13740 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALCAMQ13740 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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