Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GPM6BQ13491 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPM6BQ13491 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms