Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SF3B2Q13435 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SF3B2Q13435 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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