Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SNTA1Q13424 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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SNTA1Q13424 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SNTA1Q13424 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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