Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF1Q13351 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF1Q13351 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms