Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATMQ13315 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATMQ13315 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATMQ13315 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATMQ13315 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATMQ13315 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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