Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3FQ13275 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3FQ13275 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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