Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3BQ13214 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA3BQ13214 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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