Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF1Q13077 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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TRAF1Q13077 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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TRAF1Q13077 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF1Q13077 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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