Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDC16Q13042 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDC16Q13042 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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