Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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