Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TROQ12816 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TROQ12816 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TROQ12816 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TROQ12816 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TROQ12816 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TROQ12816 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TROQ12816 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TROQ12816 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TROQ12816 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TROQ12816 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
TROQ12816 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TROQ12816 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TROQ12816 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TROQ12816 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TROQ12816 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TROQ12816 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TROQ12816 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TROQ12816 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
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