Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YLR311CYLR311C 348 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YAR075WYAR075W 474 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NIT3YLR351C 876 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 SHH3YMR118C 591 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YNL035CYNL035C 1170 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RPL1AYPL220W 654 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 IPI3YNL182C 1668 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 AUS1YOR011W 4185 nt3.83□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 STE23YLR389C 3084 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 VBA4YDR119W 2307 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DNM1YLL001W 2274 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 KRI1YNL308C 1776 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PLM2YDR501W 1566 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YLR446WYLR446W 1302 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YCR015CYCR015C 954 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RDI1YDL135C 609 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DDI2YFL061W 678 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DID4YKL002W 699 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YKT6YKL196C 603 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PSY3YLR376C 729 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 TVP18YMR071C 504 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DDI3YNL335W 678 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YBL096CYBL096C 309 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 FYV5YCL058C 459 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 MYO5YMR109W 3660 nt3.82□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 MSM1YGR171C 1728 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DUN1YDL101C 1542 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 SMC2YFR031C 3513 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 snR78snR78 87 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 SMT3YDR510W 306 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 GRX2YDR513W 432 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 CAT5YOR125C 702 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 OXR1YPL196W 822 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 UBS1YBR165W 834 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 MSH2YOL090W 2895 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 LCB4YOR171C 1875 nt3.81□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PTM1YKL039W 1572 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NUF2YOL069W 1356 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YJR061WYJR061W 2808 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 MIG3YER028C 1185 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YHR022CYHR022C 771 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PAN5YHR063C 1140 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YMR141CYMR141C 309 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YPR053CYPR053C 456 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NTO1YPR031W 2247 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YTA7YGR270W 4140 nt3.8□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RRI1YDL216C 1323 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YDL242WYDL242W 354 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YDR336WYDR336W 945 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 KEG1YFR042W 603 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 SDP1YIL113W 630 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 EMC2YJR088C 879 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YLR012CYLR012C 300 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YSF3YNL138W-A 258 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 RPS7AYOR096W 573 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 MUM2YBR057C 1101 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YMR317WYMR317W 3423 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 FAS1YKL182W 6156 nt3.79□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 UBP8YMR223W 1416 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 HFM1YGL251C 3564 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YJR030CYJR030C 2238 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NHP10YDL002C 612 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 FAP7YDL166C 594 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 DET1YDR051C 1005 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YDR431WYDR431W 312 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YDR526CYDR526C 471 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PMI40YER003C 1290 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YGR107WYGR107W 450 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 SNX4YJL036W 1272 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 AAH1YNL141W 1044 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 PFK27YOL136C 1194 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YOL166CYOL166C 339 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 YOR114WYOR114W 885 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NUP159YIL115C 4383 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 NSP1YJL041W 2472 nt3.78□□□□□ -1.8
SNU66Q12420 TGL3YMR313C 1929 nt3.78□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 MDV1YJL112W 2145 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 KAR5YMR065W 1515 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 YGR190CYGR190C 366 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 YVH1YIR026C 1095 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 YJR037WYJR037W 384 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 YMR178WYMR178W 825 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 BAG7YOR134W 1230 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 SAS5YOR213C 747 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 PET20YPL159C 762 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 JIP5YPR169W 1479 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 PKH1YDR490C 2301 nt3.77□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 STE24YJR117W 1362 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 IZH1YDR492W 951 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 VFA1YER128W 612 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 FIP1YJR093C 984 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 VAM3YOR106W 852 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 CIN1YOR349W 3045 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 SLI1YGR212W 1407 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 RPA190YOR341W 4995 nt3.76□□□□□ -1.81
SNU66Q12420 PAM1YDR251W 2493 nt3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms