Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGEF1BQ0VAM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms