Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf54Q08AI8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C2orf54Q08AI8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms