Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLFN5Q08AF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms