Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4BQ07343 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4BQ07343 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms