Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 SWI1YPL016W 3945 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 EPO1YMR124W 2832 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MSK1YNL073W 1731 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 DPP1YDR284C 870 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YIL161WYIL161W 708 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 REH1YLR387C 1299 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YAP7YOL028C 738 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 IDH2YOR136W 1110 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 HNT3YOR258W 654 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YPR059CYPR059C 387 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 POF1YCL047C 777 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 CIT1YNR001C 1440 nt3.51□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MCM7YBR202W 2538 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 ACK1YDL203C 1872 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YDR203WYDR203W 318 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RPS18AYDR450W 441 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 FMP10YER182W 735 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RSM25YIL093C 795 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 CTK2YJL006C 972 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 REC102YLR329W 795 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 TPM1YNL079C 600 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 PEX15YOL044W 1152 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GRX7YBR014C 612 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 SPR2YOR214C 711 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RIB5YBR256C 717 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GEM1YAL048C 1989 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 HCA4YJL033W 2313 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 TAF6YGL112C 1551 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 IOC2YLR095C 2439 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GYP6YJL044C 1377 nt3.5□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 AIM21YIR003W 2040 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 AI4Q0065 1671 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YPS7YDR349C 1791 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YDL228CYDL228C 642 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MSW1YDR268W 1140 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YDR491CYDR491C 492 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RPS4BYHR203C 786 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RPS4AYJR145C 786 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GPX1YKL026C 504 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MRPL3YMR024W 1173 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 SSO2YMR183C 888 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 NIS1YNL078W 1224 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YNL181WYNL181W 1224 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RRG7YOR305W 729 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RFC5YBR087W 1065 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YBR238CYBR238C 2196 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YGL140CYGL140C 3660 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 URK1YNR012W 1506 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GCD2YGR083C 1956 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 SPT6YGR116W 4356 nt3.49□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 FAT1YBR041W 2010 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 EMC1YCL045C 2283 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 HOM2YDR158W 1098 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RPB3YIL021W 957 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 AIM19YIL087C 474 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YLR217WYLR217W 324 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YBR053CYBR053C 1077 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.48□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 ULP1YPL020C 1866 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 ATC1YDR184C 885 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 NKP1YDR383C 717 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 GPP2YER062C 753 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YKE4YIL023C 1041 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YPT52YKR014C 705 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 PAM18YLR008C 507 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YML053CYML053C 639 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MIC27YNL100W 705 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MCT1YOR221C 1083 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YBR063CYBR063C 1215 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 PHO88YBR106W 567 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MRPS9YBR146W 837 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 POP7YBR167C 423 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 REF2YDR195W 1602 nt3.47□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 NUP159YIL115C 4383 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 ENP2YGR145W 2124 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 TRS120YDR407C 3870 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YDR230WYDR230W 348 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 IRC22YEL001C 678 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 PMI40YER003C 1290 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 MIG2YGL209W 1149 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 SCM4YGR049W 564 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YGR115CYGR115C 780 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 CFD1YIL003W 882 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 IRC18YJL037W 675 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 VMA6YLR447C 1038 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 APE2YKL157W 2859 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 FAR8YMR029C 1572 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 APL4YPR029C 2499 nt3.46□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 ROD1YOR018W 2514 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YGR117CYGR117C 1431 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 TFB2YPL122C 1542 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YDR526CYDR526C 471 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YER158W-AYER158W-A 216 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YJL147CYJL147C 1149 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YBL055CYBL055C 1257 nt3.45□□□□□ -1.86
SSK1Q07084 YBR225WYBR225W 2703 nt3.45□□□□□ -1.86
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