Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FMODQ06828 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FMODQ06828 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FMODQ06828 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FMODQ06828 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms