Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAP1Q03518 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms