Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CENPCQ03188 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPCQ03188 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPCQ03188 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms