Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OC90Q02509 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OC90Q02509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OC90Q02509 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OC90Q02509 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
OC90Q02509 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
OC90Q02509 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
OC90Q02509 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
OC90Q02509 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms