Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLTCQ00610 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLTCQ00610 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms