Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA4Q00056 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA4Q00056 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms