Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED6P86452 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED6P86452 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms