Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP2P81877 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP2P81877 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms