Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEP78395 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEP78395 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms