Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PITX1P78337 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PITX1P78337 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PITX1P78337 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PITX1P78337 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PITX1P78337 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms