Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTA1P68133 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms