Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOBP62745 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOBP62745 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHOBP62745 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOBP62745 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOBP62745 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOBP62745 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms