Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPD2P62316 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNRPD2P62316 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms