Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPFP62306 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPFP62306 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPFP62306 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms