Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK-21P61565 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK-21P61565 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms