Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL3P58872 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHBDL3P58872 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL3P58872 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms