Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBASH3AP57075 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms