Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEC13P55735 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEC13P55735 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEC13P55735 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC13P55735 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC13P55735 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC13P55735 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC13P55735 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms