Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BRPF1P55201 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms