Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATN1P54259 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATN1P54259 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATN1P54259 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATN1P54259 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATN1P54259 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATN1P54259 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms