Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M2P53677 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms