Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THOP1P52888 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THOP1P52888 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
THOP1P52888 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
THOP1P52888 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THOP1P52888 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
THOP1P52888 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
THOP1P52888 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
THOP1P52888 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THOP1P52888 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
THOP1P52888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THOP1P52888 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THOP1P52888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms