Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA5P52803 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms