Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2E1P51965 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms