Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDO2P48775 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDO2P48775 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDO2P48775 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TDO2P48775 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDO2P48775 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDO2P48775 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDO2P48775 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDO2P48775 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDO2P48775 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms