Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRA2P47869 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms