Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSFP46459 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSFP46459 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSFP46459 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NSFP46459 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSFP46459 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSFP46459 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSFP46459 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSFP46459 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSFP46459 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSFP46459 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSFP46459 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NSFP46459 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSFP46459 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSFP46459 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSFP46459 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms