Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
RANGAP1P46060 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms